2117年。未来东京。怪人二十面相与明智侦探的战斗，历经7代后仍在继续。7代目小林少年所率领的少年侦探团，也仍然适度地将惊险的动作冒险夹杂在日常当中，悠然地度过每一天。但此时某个人物“怪人二十面相”却隐藏着恐怖的阴谋……。究竟7代目小林少年与7代目明智小五郎能否阻止怪人二十面相的暴走呢？

《超·少年侦探团NEO》是部有着特色个性美的动画片，观众可从中观察到弱肉强食的社会也可看到对真善美的传递和描述。《超·少年侦探团NEO》完美的诠释了一个心灵的成长史，营造一个光怪陆离的世界，这部动画是导演最为出色的佳作。故事简单但打动人心，传递着一种温暖的情感，《超·少年侦探团NEO》有着对爱的探讨，生活中的每一个瞬间，对我们来说，那都是一种成长。快乐是很简单的，快乐就是要有目标有追求;保持一颗纯真的童心;发自内心的微笑;懂得去宽容他人。无论在生命中是会遭遇有多少的困苦、艰难和波折，我们都是要保持淡然的心态。。侧面反映出了现代人对单纯、美好事物的渴求。