林婉清於祭天大典上揭穿葉清歌的女兒身，葉清歌依計還位於謝清運，假死脫身，以謝傢俬生女身份獲得重生，被指婚給了謝清運。大婚之日，蘇域認出葉清歌，痛徹心扉，與葉清歌誓死不復相見。六年後，葉清歌之子瑞琪已然長大。皇帝病危，蘇域與謝清運展開奪嫡之爭。楊恭淑趁機捉走葉清歌和瑞琪，對瑞琪和小桃子加以折磨，以要挾清運交出遺詔。謝清運闖宮，說出瑞琪是蘇域之子的真相，但一切都已覆水難收。瑞琪重病身亡，小桃子自縊而死，葉清歌因此傷心欲絕癲狂發瘋，決心遺忘一切。蘇域贖罪退位，帶葉清歌遠走天涯，過上了她從前所期盼的平凡生活。

《假凤虚凰第三季》剧情是在真实生活的基础上大胆想象 ，本剧对于服饰道化非常讲究，不仅 有别具味道的人生，还有堪称出神入化的服化道，跟以往同题材的剧集相比更有创新性，能引发观众强烈共鸣。