星元122年―― 　　在众多企业扩展到宇宙并构筑巨大经济圈的时代， 　　有一名少女自边境地区·水星转来MS产业的最大企业“贝纳里特集团”旗下所经营的“阿斯提卡西亚高等专门学园”。 　　她名为苏莱塔·墨丘利。 　　内心纯真的少女随着胸口鲜红的闪烁亮光逐步迈向新世界。

《机动战士高达：水星的魔女》故事主线是典型的黑暗童话风格，动漫以独特的喜剧风格为核心，整体充满了天马行空的奇妙幻想，配音让人满足，影片的设计多次利用镜头重叠的手法。画风绚丽多彩，角色设计层次与细节分明，剧情迷人而又充满说服力，特效达到了极高的境界，是一部寓言色彩浓烈的动画片。