故事讲述大学生?筱原百合（马场富美加）被跟踪狂困扰，因为家中邮箱被投进用过的纸巾，决定到房地产仲介公司寻找新居，负责带领她参观的房仲是二宫海里（小岛藤子）。海里对以「百合酱」来称呼对方，还说大家是小学同学，百合也记得当年海里当偶像的事，于是二人拖手拥抱，进行女性独有的亲密交流。不过百合渐渐发现海里的说话词中有意，拥抱时间过长，还有让她在意的小动作，让她开始觉得有点违和。之后海里渐渐亲近她，更主动吻向她，到底这是过于亲密的友情，还是同性之间的爱情？

《百合与直觉》主要是讲述了原以为是相爱着的夫妻的缘分因为背叛而终结，并被卷入复仇的漩涡的故事，电视剧和小说虽然主题大相径庭，一开篇就上演了“戏剧化”的一幕 ，剧集以密集的狗血情节，让人又想骂编剧又想给电视剧贡献收视率。