第一季的最后一集，当迈克（文特沃斯?米勒 Wentworth Miller 饰）和林肯（多米尼克?珀塞尔 Dominic Purcell 饰）他们跑到黑帮老大阿布鲁奇派来的飞机所停泊的地方时，飞行员因为安全问题而没等到他们就离开了。逃脱的囚犯们只能望天长叹，于是，他们各自展开了逃亡生涯。 　　FBI追捕逃犯的资深探员马宏在副总统的授权下成为捉捕小组的主管，他决定逐个击破。另一方面，莎拉的父亲因为林肯这起案件而遭灭口，她开始相信麦克了，并从父亲的遗物那里获得蛛丝马迹；副总统的手下Kellerman 前往捉捕林肯的儿子LJ准备拿他当人质时，将LJ一家都杀死了，而却被LJ意外逃脱；一直帮助林肯的律师掌握到了越来越多的线索……一切阴谋似乎都在慢慢揭开。

《越狱第二季》 调度和台词很好，该剧风格有着天马行空的想象，该剧不落俗套的笑点、无可挑剔的表演，令观众交口称赞。《越狱第二季》有着镜头重叠的叙事手法，整体故事情节构思精巧，该片具有了回顾历史、发人沉思的艺术效果，很大的拓展了该片的表现空间。